opsd_bovin

NAME

2X72

ORGANISM

Bovine (Bos taurus)

PROTEIN NAME

opsd_bovin

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
                
N-term        
M
N
G
T
E
G
P
N
F
Y
10
                   
                   
V
P
F
S
N
K
T
G
V
V
20
                   
                   
R
S
P
F
E
A
P
Q
Y
Y
30
                   
    TM1          
L
A
E
P
W
Q
F
S
M
L
40
                   
                   
A
A
Y
M
F
L
L
I
M
L
50
                   
                   
G
F
P
I
N
F
L
T
L
Y
60
                   
          ICL1  
V
T
V
Q
H
K
K
L
R
T
70
                   
TM2              
P
L
N
Y
I
L
L
N
L
A
80
                   
                   
V
A
D
L
F
M
V
F
G
G
90
                   
                   
F
T
T
T
L
Y
T
S
L
H
100
                   
  ECL1 TM3    
G
Y
F
V
F
G
P
T
G
C
110
   
 
              
                   
N
L
E
G
F
F
A
T
L
G
120
                   
                   
G
E
I
A
L
W
S
L
V
V
130
                   
                   
L
A
I
E
R
Y
V
V
V
C
140
                   
  ICL2          
K
P
M
S
N
F
R
F
G
E
150
                   
TM4              
N
H
A
I
M
G
V
A
F
T
160
                   
                   
W
V
M
A
L
A
C
A
A
P
170
                   
        ECL2    
P
L
V
G
W
S
R
Y
I
P
180
                   
                   
E
G
M
Q
C
S
C
G
I
D
190
                   
                   
Y
Y
T
P
H
E
E
T
N
N
200
                   
TM5              
E
S
F
V
I
Y
M
F
V
V
210
                   
                   
H
F
I
I
P
L
I
V
I
F
220
                   
                   
F
C
Y
G
Q
L
V
F
T
V
230
                   
                   
K
E
A
A
A
Q
Q
Q
E
S
240
                   
TM6              
A
T
T
Q
K
A
E
K
E
V
250
                   
                   
T
R
M
V
I
I
M
V
I
A
260
                   
                   
F
L
I
C
W
L
P
Y
A
G
270
                   
                   
V
A
F
Y
I
F
T
H
Q
G
280
 
 
                
ECL3 TM7      
S
D
F
G
P
I
F
M
T
I
290
                   
                   
P
A
F
F
A
K
T
S
A
V
300
                   
                   
Y
N
P
V
I
Y
I
M
M
N
310
                   
H8                
K
Q
F
R
N
C
M
V
T
T
320
                   
    C-term    
L
C
C
G
K
N
P
L
G
D
330
                   
                   
D
E
A
S
T
T
V
S
K
T
340
               
               
E
T
S
Q
V
A
P
A
 
 
                
N-term        
M
C
G
T
E
G
P
N
F
Y
10
                   
                   
V
P
F
S
N
K
T
G
V
V
20
                   
                   
R
S
P
F
E
A
P
Q
Y
Y
30
                   
    TM1          
L
A
E
P
W
Q
F
S
M
L
40
                   
                   
A
A
Y
M
F
L
L
I
M
L
50
                   
                   
G
F
P
I
N
F
L
T
L
Y
60
                   
          ICL1  
V
T
V
Q
H
K
K
L
R
T
70
                   
TM2              
P
L
N
Y
I
L
L
N
L
A
80
                   
                   
V
A
D
L
F
M
V
F
G
G
90
                   
                   
F
T
T
T
L
Y
T
S
L
H
100
                   
  ECL1 TM3    
G
Y
F
V
F
G
P
T
G
C
110
   
 
              
                   
N
L
Q
G
F
F
A
T
L
G
120
                   
                   
G
E
I
A
L
W
S
L
V
V
130
                   
                   
L
A
I
E
R
Y
V
V
V
C
140
                   
  ICL2          
K
P
M
S
N
F
R
F
G
E
150
                   
TM4              
N
H
A
I
M
G
V
A
F
T
160
                   
                   
W
V
M
A
L
A
C
A
A
P
170
                   
        ECL2    
P
L
V
G
W
S
R
Y
I
P
180
                   
                   
E
G
M
Q
C
S
C
G
I
D
190
                   
                   
Y
Y
T
P
H
E
E
T
N
N
200
                   
TM5              
E
S
F
V
I
Y
M
F
V
V
210
                   
                   
H
F
I
I
P
L
I
V
I
F
220
                   
                   
F
C
Y
G
Q
L
V
F
T
V
230
                   
                   
K
E
A
A
A
Q
Q
Q
E
S
240
                   
TM6              
A
T
T
Q
K
A
E
K
E
V
250
                   
                   
T
R
M
V
I
I
M
V
I
A
260
                   
                   
F
L
I
C
W
L
P
Y
A
G
270
                   
                   
V
A
F
Y
I
F
T
H
Q
G
280
 
 
                
ECL3 TM7      
S
C
F
G
P
I
F
M
T
I
290
                   
                   
P
A
F
F
A
K
T
S
A
V
300
                   
                   
Y
N
P
V
I
Y
I
M
M
N
310
                   
H8                
K
Q
F
R
N
C
M
V
T
T
320
                   
    C-term    
L
C
C
G
K
N
P
L
G
D
330
                   
                   
D
E
A
S
T
T
V
S
K
T
340
               
               
E
T
S
Q
V
A
P
A
348

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
 
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
C-term

 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
 
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
C-term


DIAGRAMS

ICL1 K K L R ICL1ECL1 Y F V F ECL1ICL2 P M S N F R F ICL2ECL2 W S R Y I P E G M Q C S C G I D Y Y T P H E E T ECL2ICL3 Q E ICL3ECL3 Q G S D F ECL3N-term M N G T E G P N F Y V P F S N K T G V V R S P F E A P Q Y Y L A N-termC-term C G K N P L G D D E A S T T V S K T E T S Q V A P A C-term E P W Q F S M L A A Y M F L L I M L G F P I N F L T L Y V T V Q H T P L N Y I L L N L A V A D L F M V F G G F T T T L Y T S L H G G P T G C N L E G F F A T L G G E I A L W S L V V L A I E R Y V V V C K G E N H A I M G V A F T W V M A L A C A A P P L V G N N E S F V I Y M F V V H F I I P L I V I F F C Y G Q L V F T V K E A A A Q Q S A T T Q K A E K E V T R M V I I M V I A F L I C W L P Y A G V A F Y I F T H G P I F M T I P A F F A K T S A V Y N P V I Y I M M N K Q M V T F R N C T L C

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
2 |  N C
113 |  E Q
282 |  D C

DELETIONS


MODIFICATIONS


AUXILIARY PROTEINS


EXPRESSION

Expression method Host cell type Host cell Remarks
Stable_cells HEK293S-GnTI- Mammalian

SOLUBILIZATION

Solvent type Item Concentration
detergent DM 1.25 %w/v

Remarks:

PURIFICATION

Purification type Description
Detergent DM exchanged to 1% OG None

Remarks:None

CRYSTALLIZATION

METHOD: vapour diffusion
TYPE: sitting drop ()
PROTEIN CONCENTRATION: 5-7.5 mg/ml
Temperature: 4°C
ph : 4.5-4.5

Remarks: E113Q mutant, all experiments and crystallization with retinal carried out under dim red light

Chemical lists

Type Item Concentration
Additional
unknown Sodium acetate, pH 4.5 100 mM
unknown Ammonium sulfate 3.0-3.4 M
Detergent
OG 1 %w/v