opsd_todpa
NAME
3AYN
ORGANISM
Japanese flying squid (Todarodes pacificus)
PROTEIN NAME
opsd_todpa
SOURCE
SWISSPROT
SEQUENCE
Perspective:
Wild-type
Construct
| N-term | |||||||||
|
M
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A
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| 160 | |||||||||
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| ECL2 | |||||||||
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| 230 | |||||||||
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| 270 | |||||||||
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| 300 | |||||||||
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| 320 | |||||||||
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D
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S
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| 360 | |||||||||
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| 370 | |||||||||
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| 400 | |||||||||
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| 400 | |||||||||
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| 430 | |||||||||
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| 448 | |||||||
SCHEMATIC
Perspective:
Wild-type
Construct
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DIAGRAMS
MUTATIONS
| Position | Wild-type | Mutated |
|---|
DELETIONS
MODIFICATIONS
AUXILIARY PROTEINS
EXPRESSION
| Expression method | Host cell type | Host cell | Remarks |
|---|---|---|---|
| NA | Native | Squid |
SOLUBILIZATION
| Solvent type | Item | Concentration |
|---|---|---|
| detergent | OG | 100.0 mM |
Remarks:
PURIFICATION
| Purification type | Description |
|---|---|
| Proteolysis by V8 protease | None |
Remarks:None
CRYSTALLIZATION
METHOD: vapour diffusion
TYPE: sitting drop ()
PROTEIN CONCENTRATION: 10 mg/ml
Temperature: 4°C
ph : 6.0-6.0
Remarks: 30mM zinc acetate, and,100mM octylglucoside with a detergent/protein ratio of cca3.7 (w/w)
Chemical lists
| Type | Item | Concentration |
|---|---|---|
| Additional | ||
| unknown | Ammonium sulfate | 3.2 M |
| unknown | MES pH 6.4 | 20 mM |
| unknown | beta-mercaptoethanol | 10 mM |
| unknown | EDTA | 50 mM |
| Detergent | ||
| detergent | OG(octylglucoside) | 100 mM |