oprd_mouse

NAME

4EJ4

ORGANISM

Mouse (Mus musculus)

PROTEIN NAME

oprd_mouse

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
E
L
V
P
S
A
R
A
E
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
Q
S
S
P
L
V
N
L
S
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
D
A
F
P
S
A
F
P
S
A
30
 
 
 
 
 
          
                   
G
A
N
A
S
G
S
P
G
A
40
                   
TM1              
R
S
A
S
S
L
A
L
A
I
50
                   
                   
A
I
T
A
L
Y
S
A
V
C
60
                   
                   
A
V
G
L
L
G
N
V
L
V
70
                   
                   
M
F
G
I
V
R
Y
T
K
L
80
                   
ICL1 TM2      
K
T
A
T
N
I
Y
I
F
N
90
                   
                   
L
A
L
A
D
A
L
A
T
S
100
                   
                   
T
L
P
F
Q
S
A
K
Y
L
110
                   
    ECL1 TM3  
M
E
T
W
P
F
G
E
L
L
120
                   
                   
C
K
A
V
L
S
I
D
Y
Y
130
                   
                   
N
M
F
T
S
I
F
T
L
T
140
                   
                   
M
M
S
V
D
R
Y
I
A
V
150
                   
    ICL2        
C
H
P
V
K
A
L
D
F
R
160
                   
TM4              
T
P
A
K
A
K
L
I
N
I
170
                   
                   
C
I
W
V
L
A
S
G
V
G
180
                   
                   
V
P
I
M
V
M
A
V
T
Q
190
                   
ECL2            
P
R
D
G
A
V
V
C
M
L
200
                   
        TM5      
Q
F
P
S
P
S
W
Y
W
D
210
                   
                   
T
V
T
K
I
C
V
F
L
F
220
                   
                   
A
F
V
V
P
I
L
I
I
T
230
                   
                   
V
C
Y
G
L
M
L
L
R
L
240
       
 
 
 
 
 
 
      ICL3      
R
S
V
R
L
L
S
G
S
K
250
                   
TM6              
E
K
D
R
S
L
R
R
I
T
260
                   
                   
R
M
V
L
V
V
V
G
A
F
270
                   
                   
V
V
C
W
A
P
I
H
I
F
280
                   
                   
V
I
V
W
T
L
V
D
I
N
290
                   
ECL3 TM7      
R
R
D
P
L
V
V
A
A
L
300
                   
                   
H
L
C
I
A
L
G
Y
A
N
310
                   
                   
S
S
L
N
P
V
L
Y
A
F
320
                   
  H8              
L
D
E
N
F
K
R
C
F
R
330
                   
                   
Q
L
C
R
T
P
C
G
R
Q
340
   
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term        
E
P
G
S
L
R
R
P
R
Q
350
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
T
T
R
E
R
V
T
A
C
360
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
P
S
D
G
P
G
G
G
A
370
 
 
   
A
A
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
                  
  N-term TM1
 
G
S
P
G
A
R
S
A
S
44
                   
                   
S
L
A
L
A
I
A
I
T
A
54
                   
                   
L
Y
S
A
V
C
A
V
G
L
64
                   
                   
L
G
N
V
L
V
M
F
G
I
74
                   
      ICL1 TM2
V
R
Y
T
K
L
K
T
A
T
84
                   
                   
N
I
Y
I
F
N
L
A
L
A
94
                   
                   
D
A
L
A
T
S
T
L
P
F
104
                   
                   
Q
S
A
K
Y
L
M
E
T
W
114
                   
ECL1 TM3      
P
F
G
E
L
L
C
K
A
V
124
                   
                   
L
S
I
D
Y
Y
N
M
F
T
134
                   
                   
S
I
F
T
L
T
M
M
S
V
144
                   
                   
D
R
Y
I
A
V
C
H
P
V
154
                   
ICL2     TM4  
K
A
L
D
F
R
T
P
A
K
164
                   
                   
A
K
L
I
N
I
C
I
W
V
174
                   
                   
L
A
S
G
V
G
V
P
I
M
184
                   
      ECL2      
V
M
A
V
T
Q
P
R
D
G
194
                   
                   
A
V
V
C
M
L
Q
F
P
S
204
                   
TM5              
P
S
W
Y
W
D
T
V
T
K
214
                   
                   
I
C
V
F
L
F
A
F
V
V
224
                   
                   
P
I
L
I
I
T
V
C
Y
G
234
                   
 
                     
L
M
L
L
R
L
R
S
V
R
 
244
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lysozyme
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
               
TM6          
E
K
D
R
S
L
R
R
258
                   
                   
I
T
R
M
V
L
V
V
V
G
268
                   
                   
A
F
V
V
C
W
A
P
I
H
278
                   
                   
I
F
V
I
V
W
T
L
V
D
288
                   
ECL3 TM7      
I
N
R
R
D
P
L
V
V
A
298
                   
                   
A
L
H
L
C
I
A
L
G
Y
308
                   
                   
A
N
S
S
L
N
P
V
L
Y
318
                   
      H8          
A
F
L
D
E
N
F
K
R
C
328
                   
                   
F
R
Q
L
C
R
T
P
C
G
338
       
 
C-term
R
Q
E
P
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(8)        

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
 
 
 
 
ICL3
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
TM5 
 
ICL3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(8)


DIAGRAMS

ICL1 T K L K ICL1ECL1 T W P F ECL1ICL2 P V K A L D F R ICL2ECL2 V T Q P R D G A V V C M L Q F P S ECL2ICL3 R L L S G ICL3ECL3 D I N R R ECL3N-term M E L V P S A R A E L Q S S P L V N L S D A F P S A F P S A G A N A S G S P G A N-termC-term P C G R Q E P G S L R R P R Q A T T R E R V T A C T P S D G P G G G A A A C-term R S A S S L A L A I A I T A L Y S A V C A V G L L G N V L V M F G I V R Y T A T N I Y I F N L A L A D A L A T S T L P F Q S A K Y L M E G E L L C K A V L S I D Y Y N M F T S I F T L T M M S V D R Y I A V C H T P A K A K L I N I C I W V L A S G V G V P I M V M A P S W Y W D T V T K I C V F L F A F V V P I L I I T V C Y G L M L L R L R S V S K E K D R S L R R I T R M V L V V V G A F V V C W A P I H I F V I V W T L V D P L V V A A L H L C I A L G Y A N S S L N P V L Y A F L D E N F R Q F K R C L C R T

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated

DELETIONS

  • from 1 to 35
  • from 245 to 250
  • from 343 to 372

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: TEV protease
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_1 35:35
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 245:250
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(8)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect pFastBac1

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    additive CHS 0.03 %w/v
    detergent LMNG 1 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Proteolysis by TEV protease None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 50 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 7.5-7.5

    Remarks: Protein was mixed 1:1.5 (w:w) with 91% monoolein 9% cholesterol mixture by weight

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown HEPES pH 7.5 100 mM
    unknown PEG 400 29-33 % v/v
    unknown Sodium Citrate 120-180 mM
    unknown Magnesium Chloride 350 mM
    Detergent
    detergent LMNG 0.01 % w/v
    Lipid
    lipid CHS 0.001 %w/v