ccr5_human

NAME

4MBS

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

ccr5_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
                  
N-term        
M
D
Y
Q
V
S
S
P
I
Y
10
                   
                   
D
I
N
Y
Y
T
S
E
P
C
20
                   
  TM1            
Q
K
I
N
V
K
Q
I
A
A
30
                   
                   
R
L
L
P
P
L
Y
S
L
V
40
                   
                   
F
I
F
G
F
V
G
N
M
L
50
             
 
    
                   
V
I
L
I
L
I
N
C
K
R
60
                   
ICL1 TM2      
L
K
S
M
T
D
I
Y
L
L
70
                   
                   
N
L
A
I
S
D
L
F
F
L
80
                   
                   
L
T
V
P
F
W
A
H
Y
A
90
                   
    ECL1 TM3  
A
A
Q
W
D
F
G
N
T
M
100
                   
                   
C
Q
L
L
T
G
L
Y
F
I
110
                   
                   
G
F
F
S
G
I
F
F
I
I
120
                   
                   
L
L
T
I
D
R
Y
L
A
V
130
                   
    ICL2        
V
H
A
V
F
A
L
K
A
R
140
                   
TM4              
T
V
T
F
G
V
V
T
S
V
150
                   
                   
I
T
W
V
V
A
V
F
A
S
160
   
 
              
                   
L
P
G
I
I
F
T
R
S
Q
170
                   
ECL2            
K
E
G
L
H
Y
T
C
S
S
180
                   
          TM5    
H
F
P
Y
S
Q
Y
Q
F
W
190
                   
                   
K
N
F
Q
T
L
K
I
V
I
200
                   
                   
L
G
L
V
L
P
L
L
V
M
210
                   
                   
V
I
C
Y
S
G
I
L
K
T
220
     
 
 
 
        
        ICL3 TM6
L
L
R
C
R
N
E
K
K
R
230
   
 
              
                 
H
R
A
V
R
L
I
F
T
I
240
                   
                   
M
I
V
Y
F
L
F
W
A
P
250
                   
                   
Y
N
I
V
L
L
L
N
T
F
260
                   
          ECL3 TM7
Q
E
F
F
G
L
N
N
C
S
270
                   
               
S
S
N
R
L
D
Q
A
M
Q
280
                   
                   
V
T
E
T
L
G
M
T
H
C
290
                   
                   
C
I
N
P
I
I
Y
A
F
V
300
   
 
              
H8                
G
E
K
F
R
N
Y
L
L
V
310
                   
      C-term  
F
F
Q
K
H
I
A
K
R
F
320
                   
                   
C
K
C
C
S
I
F
Q
Q
E
330
                   
                   
A
P
E
R
A
S
S
V
Y
T
340
                   
                   
R
S
T
G
E
Q
E
I
S
V
350
   
   
G
L
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
                  
  N-term      
 
D
Y
Q
V
S
S
P
I
Y
10
                   
                   
D
I
N
Y
Y
T
S
E
P
C
20
                   
  TM1            
Q
K
I
N
V
K
Q
I
A
A
30
                   
                   
R
L
L
P
P
L
Y
S
L
V
40
                   
                   
F
I
F
G
F
V
G
N
M
L
50
             
 
    
                   
V
I
L
I
L
I
N
Y
K
R
60
                   
ICL1 TM2      
L
K
S
M
T
D
I
Y
L
L
70
                   
                   
N
L
A
I
S
D
L
F
F
L
80
                   
                   
L
T
V
P
F
W
A
H
Y
A
90
                   
    ECL1 TM3  
A
A
Q
W
D
F
G
N
T
M
100
                   
                   
C
Q
L
L
T
G
L
Y
F
I
110
                   
                   
G
F
F
S
G
I
F
F
I
I
120
                   
                   
L
L
T
I
D
R
Y
L
A
V
130
                   
    ICL2        
V
H
A
V
F
A
L
K
A
R
140
                   
TM4              
T
V
T
F
G
V
V
T
S
V
150
                   
                   
I
T
W
V
V
A
V
F
A
S
160
   
 
              
                   
L
P
N
I
I
F
T
R
S
Q
170
                   
ECL2            
K
E
G
L
H
Y
T
C
S
S
180
                   
          TM5    
H
F
P
Y
S
Q
Y
Q
F
W
190
                   
                   
K
N
F
Q
T
L
K
I
V
I
200
                   
                   
L
G
L
V
L
P
L
L
V
M
210
                   
                   
V
I
C
Y
S
G
I
L
K
T
220
     
 
       
L
L
R
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Rubredoxin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
           
 
  
TM6          
E
K
K
R
H
R
D
V
234
                   
                   
R
L
I
F
T
I
M
I
V
Y
244
                   
                   
F
L
F
W
A
P
Y
N
I
V
254
                   
                   
L
L
L
N
T
F
Q
E
F
F
264
                   
  ECL3 TM7    
G
L
N
N
C
S
S
S
N
R
274
                   
                   
L
D
Q
A
M
Q
V
T
E
T
284
                   
                   
L
G
M
T
H
C
C
I
N
P
294
               
 
  
            H8    
I
I
Y
A
F
V
G
E
E
F
304
                   
                   
R
N
Y
L
L
V
F
F
Q
K
314
                   
C-term        
H
I
A
K
R
F
C
K
C
C
324
                   
                   
S
I
F
Q
Q
E
A
P
E
R
334
                   
                   
A
S
S
V
Y
T
R
S
T
G
344
               
               
E
Q
E
I
S
V
G
L
352
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreScission
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
N-term
 
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
 
 
TM4
 
ECL2
 
 
TM5
 
ICL3
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
 
H8
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 N-term
 
 
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
 
 
TM4
 
ECL2
 
 
TM5 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Rubred
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
 
H8
 
C-term
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreSci
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 K R L K ICL1ECL1 Q W D F ECL1ICL2 A V F A L K A R ICL2ECL2 R S Q K E G L H Y T C S S H F P Y S ECL2ICL3 R ICL3ECL3 L N ECL3N-term M D Y Q V S S P I Y D I N Y Y T S E P C Q N-termC-term K H I A K R F C K C C S I F Q Q E A P E R A S S V Y T R S T G E Q E I S V G L C-term K I N V K Q I A A R L L P P L Y S L V F I F G F V G N M L V I L I L I N C S M T D I Y L L N L A I S D L F F L L T V P F W A H Y A A A G N T M C Q L L T G L Y F I G F F S G I F F I I L L T I D R Y L A V V H T V T F G V V T S V I T W V V A V F A S L P G I I F T Q Y Q F W K N F Q T L K I V I L G L V L P L L V M V I C Y S G I L K T L L R C N E K K R H R A V R L I F T I M I V Y F L F W A P Y N I V L L L N T F Q E F F G N C S S S N R L D Q A M Q V T E T L G M T H C C I N P I I Y A F V G E K L L V F R N Y F F Q

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
58 |  C Y
163 |  G N
233 |  A D
303 |  K E

DELETIONS

  • from 1 to 1
  • from 224 to 226

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: Rubredoxin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_1 224:226
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: PreScission site
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_2 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect pFastBac1 and Bac-to-Bac

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    additive CHS 0.1 %w/v
    detergent DDM 0.5 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Proteolysis by HRV 3C protease None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 40 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 7.0-7.0

    Remarks: the protein-LCP mixture contained 40% (w/w) receptor solution, 54% (w/w)monoolein, and 6% (w/w) cholesterol.

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    HEPES, pH 7.0 100.0 mM
    PEG400 32-38 %(v/v)
    NaCl 100-200 mM
    Detergent
    detergent DDM 0.05 % w/v
    Lipid
    lipid CHS 0.01 %w/v