smo_human

NAME

4O9R

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

smo_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
A
A
A
R
P
A
R
G
P
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
L
P
L
L
G
L
L
L
L
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
L
L
G
D
P
G
R
G
A
30
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
S
S
G
N
A
T
G
P
G
40
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
R
S
A
G
G
S
A
R
R
50
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
A
A
V
T
G
P
P
P
P
60
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
S
H
C
G
R
A
A
P
C
70
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
P
L
R
Y
N
V
C
L
G
80
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
V
L
P
Y
G
A
T
S
T
90
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
L
A
G
D
S
D
S
Q
E
100
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
A
H
G
K
L
V
L
W
S
110
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
L
R
N
A
P
R
C
W
A
120
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
I
Q
P
L
L
C
A
V
Y
130
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
M
P
K
C
E
N
D
R
V
E
140
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
P
S
R
T
L
C
Q
A
T
150
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
G
P
C
A
I
V
E
R
E
160
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
G
W
P
D
F
L
R
C
T
170
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
D
R
F
P
E
G
C
T
N
180
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  
                   
E
V
Q
N
I
K
F
N
S
S
190
                   
                   
G
Q
C
E
V
P
L
V
R
T
200
                   
                   
D
N
P
K
S
W
Y
E
D
V
210
                   
                   
E
G
C
G
I
Q
C
Q
N
P
220
                   
    TM1          
L
F
T
E
A
E
H
Q
D
M
230
                   
                   
H
S
Y
I
A
A
F
G
A
V
240
                   
                   
T
G
L
C
T
L
F
T
L
A
250
                   
          ICL1  
T
F
V
A
D
W
R
N
S
N
260
                   
TM2              
R
Y
P
A
V
I
L
F
Y
V
270
                   
                   
N
A
C
F
F
V
G
S
I
G
280
                   
          ECL1  
W
L
A
Q
F
M
D
G
A
R
290
                   
                   
R
E
I
V
C
R
A
D
G
T
300
                   
                   
M
R
L
G
E
P
T
S
N
E
310
                   
  TM3            
T
L
S
C
V
I
I
F
V
I
320
                   
                   
V
Y
Y
A
L
M
A
G
V
V
330
                   
                   
W
F
V
V
L
T
Y
A
W
H
340
                   
          ICL2  
T
S
F
K
A
L
G
T
T
Y
350
                   
          TM4    
Q
P
L
S
G
K
T
S
Y
F
360
                   
                   
H
L
L
T
W
S
L
P
F
V
370
                   
                   
L
T
V
A
I
L
A
V
A
Q
380
                   
ECL2            
V
D
G
D
S
V
S
G
I
C
390
                   
          TM5    
F
V
G
Y
K
N
Y
R
Y
R
400
                   
                   
A
G
F
V
L
A
P
I
G
L
410
                   
                   
V
L
I
V
G
G
Y
F
L
I
420
                   
                   
R
G
V
M
T
L
F
S
I
K
430
     
 
 
 
 
 
 
 
      ICL3 TM6
S
N
H
P
G
L
L
S
E
K
440
                   
                   
A
A
S
K
I
N
E
T
M
L
450
                   
                   
R
L
G
I
F
G
F
L
A
F
460
                   
                   
G
F
V
L
I
T
F
S
C
H
470
                   
                   
F
Y
D
F
F
N
Q
A
E
W
480
                   
                   
E
R
S
F
R
D
Y
V
L
C
490
                   
            ECL3
Q
A
N
V
T
I
G
L
P
T
500
                   
                   
K
Q
P
I
P
D
C
E
I
K
510
                   
      TM7        
N
R
P
S
L
L
V
E
K
I
520
                   
                   
N
L
F
A
M
F
G
T
G
I
530
                   
              H8  
A
M
S
T
W
V
W
T
K
A
540
                   
                   
T
L
L
I
W
R
R
T
W
C
550
         
 
 
 
 
 
      C-term  
R
L
T
G
Q
S
D
D
E
P
560
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
R
I
K
K
S
K
M
I
A
570
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
A
F
S
K
R
H
E
L
L
580
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Q
N
P
G
Q
E
L
S
F
S
590
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
M
H
T
V
S
H
D
G
P
V
600
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
G
L
A
F
D
L
N
E
P
610
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
A
D
V
S
S
A
W
A
Q
620
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
H
V
T
K
M
V
A
R
R
G
630
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
I
L
P
Q
D
I
S
V
T
640
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
V
A
T
P
V
P
P
E
E
650
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Q
A
N
L
W
L
V
E
A
E
660
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
S
P
E
L
Q
K
R
L
G
670
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
K
K
K
R
R
K
R
K
K
680
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
V
C
P
L
A
P
P
P
E
690
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
H
P
P
A
P
A
P
S
T
700
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
P
R
L
P
Q
L
P
R
Q
710
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
C
L
V
A
A
G
A
W
G
720
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
G
D
S
C
R
Q
G
A
W
730
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
L
V
S
N
P
F
C
P
E
740
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
S
P
P
Q
D
P
F
L
P
750
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
A
P
A
P
V
A
W
A
H
760
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
R
R
Q
G
L
G
P
I
H
770
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
R
T
N
L
M
D
T
E
L
780
 
 
 
 
 
 
 
             
M
D
A
D
S
D
F
 
                  
  N-term      
 
S
G
Q
C
E
V
P
L
V
198
                   
                   
R
T
D
N
P
K
S
W
Y
E
208
                   
                   
D
V
E
G
C
G
I
Q
C
Q
218
                   
        TM1      
N
P
L
F
T
E
A
E
H
Q
228
                   
                   
D
M
H
S
Y
I
A
A
F
G
238
                   
                   
A
V
T
G
L
C
T
L
F
T
248
                   
                   
L
A
T
F
V
A
D
W
R
N
258
                   
ICL1 TM2      
S
N
R
Y
P
A
V
I
L
F
268
                   
                   
Y
V
N
A
C
F
F
V
G
S
278
                   
                   
I
G
W
L
A
Q
F
M
D
G
288
                   
ECL1            
A
R
R
E
I
V
C
R
A
D
298
                   
                   
G
T
M
R
L
G
E
P
T
S
308
                   
      TM3        
N
E
T
L
S
C
V
I
I
F
318
                   
                   
V
I
V
Y
Y
A
L
M
A
G
328
                   
                   
V
V
W
F
V
V
L
T
Y
A
338
                   
                   
W
H
T
S
F
K
A
L
G
T
348
                   
ICL2       TM4
T
Y
Q
P
L
S
G
K
T
S
358
                   
                   
Y
F
H
L
L
T
W
S
L
P
368
                   
                   
F
V
L
T
V
A
I
L
A
V
378
                   
  ECL2          
A
Q
V
D
G
D
S
V
S
G
388
                   
              TM5
I
C
F
V
G
Y
K
N
Y
R
398
                   
                   
Y
R
A
G
F
V
L
A
P
I
408
                   
                   
G
L
V
L
I
V
G
G
Y
F
418
                   
                   
L
I
R
G
V
M
T
L
F
S
428
         
 
           
I
K
S
N
H
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
BRIL (b562R
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
               
TM6          
A
A
S
K
I
N
E
T
448
                   
                   
M
L
R
L
G
I
F
G
F
L
458
                   
                   
A
F
G
F
V
L
I
T
F
S
468
                   
                   
C
H
F
Y
D
F
F
N
Q
A
478
                   
                   
E
W
E
R
S
F
R
D
Y
V
488
                   
                   
L
C
Q
A
N
V
T
I
G
L
498
                   
ECL3            
P
T
K
Q
P
I
P
D
C
E
508
                   
          TM7    
I
K
N
R
P
S
L
L
V
E
518
                   
                   
K
I
N
L
F
A
M
F
G
T
528
                   
                   
G
I
A
M
S
T
W
V
W
T
538
                   
H8                
K
A
T
L
L
I
W
R
R
T
548
             
 
               
W
C
R
L
T
G
Q
 

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
 
 
 
ICL3
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
TM5 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
BRIL (
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 


DIAGRAMS

ICL1 W R N S N ICL1ECL1 M D G A R R E I V C R A D G T M R L G E P T S N E T ECL1ICL2 L G T T Y Q P L S G ICL2ECL2 Q V D G D S V S G I C F V G Y K ECL2ICL3 P G L L ICL3ECL3 G L P T K Q P I P D C E I K N R P ECL3N-term M A A A R P A R G P E L P L L G L L L L L L L G D P G R G A A S S G N A T G P G P R S A G G S A R R S A A V T G P P P P L S H C G R A A P C E P L R Y N V C L G S V L P Y G A T S T L L A G D S D S Q E E A H G K L V L W S G L R N A P R C W A V I Q P L L C A V Y M P K C E N D R V E L P S R T L C Q A T R G P C A I V E R E R G W P D F L R C T P D R F P E G C T N E V Q N I K F N S S G Q C E V P L V R T D N P K S W Y E D V E G C G I Q C Q N P L F N-termC-term G Q S D D E P K R I K K S K M I A K A F S K R H E L L Q N P G Q E L S F S M H T V S H D G P V A G L A F D L N E P S A D V S S A W A Q H V T K M V A R R G A I L P Q D I S V T P V A T P V P P E E Q A N L W L V E A E I S P E L Q K R L G R K K K R R K R K K E V C P L A P P P E L H P P A P A P S T I P R L P Q L P R Q K C L V A A G A W G A G D S C R Q G A W T L V S N P F C P E P S P P Q D P F L P S A P A P V A W A H G R R Q G L G P I H S R T N L M D T E L M D A D S D F C-term T E A E H Q D M H S Y I A A F G A V T G L C T L F T L A T F V A D R Y P A V I L F Y V N A C F F V G S I G W L A Q F L S C V I I F V I V Y Y A L M A G V V W F V V L T Y A W H T S F K A K T S Y F H L L T W S L P F V L T V A I L A V A N Y R Y R A G F V L A P I G L V L I V G G Y F L I R G V M T L F S I K S N H S E K A A S K I N E T M L R L G I F G F L A F G F V L I T F S C H F Y D F F N Q A E W E R S F R D Y V L C Q A N V T I S L L V E K I N L F A M F G T G I A M S T W V W T K A W R R L T T L L I T W C R

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated

DELETIONS

  • from 1 to 189
  • from 434 to 440
  • from 556 to 787

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: fusion

    Name: BRIL (b562RIL)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_0 434:440
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect NA

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1.0 %w/v
    additive CHS 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 35 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 7.4-7.4

    Remarks: Mutations within BRIL:M29WH124IR128LCrystallization in syringe. 7.9 MAG added to prevent formation of Lc phase for FEL experiment

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown HEPES, pH 7.0 100 mM
    unknown Sodium chloride 100 mM
    unknown PEG400 30 %(v/v)
    Detergent
    detergent DDM 0.03 %(w/v)
    Lipid
    lipid CHS 0.006 %(w/v)