p2ry1_human

NAME

4XNV

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

p2ry1_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
            
 
    
N-term        
M
T
E
V
L
W
P
A
V
P
10
                   
                   
N
G
T
D
A
A
F
L
A
G
20
                   
                   
P
G
S
S
W
G
N
S
T
V
30
                   
                   
A
S
T
A
A
V
S
S
S
F
40
                   
                   
K
C
A
L
T
K
T
G
F
Q
50
                   
TM1              
F
Y
Y
L
P
A
V
Y
I
L
60
                   
                   
V
F
I
I
G
F
L
G
N
S
70
                   
                   
V
A
I
W
M
F
V
F
H
M
80
                   
ICL1 TM2      
K
P
W
S
G
I
S
V
Y
M
90
                   
                   
F
N
L
A
L
A
D
F
L
Y
100
                   
                   
V
L
T
L
P
A
L
I
F
Y
110
                   
      ECL1      
Y
F
N
K
T
D
W
I
F
G
120
                   
TM3              
D
A
M
C
K
L
Q
R
F
I
130
                   
                   
F
H
V
N
L
Y
G
S
I
L
140
                   
                   
F
L
T
C
I
S
A
H
R
Y
150
                   
          ICL2  
S
G
V
V
Y
P
L
K
S
L
160
                   
      TM4        
G
R
L
K
K
K
N
A
I
C
170
                   
                   
I
S
V
L
V
W
L
I
V
V
180
                   
                   
V
A
I
S
P
I
L
F
Y
S
190
                   
ECL2            
G
T
G
V
R
K
N
K
T
I
200
                   
                   
T
C
Y
D
T
T
S
D
E
Y
210
                   
TM5              
L
R
S
Y
F
I
Y
S
M
C
220
                   
                   
T
T
V
A
M
F
C
V
P
L
230
                   
                   
V
L
I
L
G
C
Y
G
L
I
240
             
 
 
 
                   
V
R
A
L
I
Y
K
D
L
D
250
 
 
                
ICL3 TM6      
N
S
P
L
R
R
K
S
I
Y
260
                   
                   
L
V
I
I
V
L
T
V
F
A
270
                   
                   
V
S
Y
I
P
F
H
V
M
K
280
                   
                   
T
M
N
L
R
A
R
L
D
F
290
                   
ECL3 TM7      
Q
T
P
A
M
C
A
F
N
D
300
                   
                   
R
V
Y
A
T
Y
Q
V
T
R
310
                 
 
                   
G
L
A
S
L
N
S
C
V
D
320
                   
              H8  
P
I
L
Y
F
L
A
G
D
T
330
                   
                   
F
R
R
R
L
S
R
A
T
R
340
                   
C-term        
K
A
S
R
R
S
E
A
N
L
350
                   
                   
Q
S
K
S
E
D
M
T
L
N
360
                   
                   
I
L
P
E
F
K
Q
N
G
D
370
     
     
T
S
L
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
            
  N-term
 
T
E
V
L
W
P
7
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                
                 
A
V
P
N
G
T
D
A
A
16
                   
                   
F
L
A
G
P
G
S
S
W
G
26
                   
                   
N
S
T
V
A
S
T
A
A
V
36
                   
                   
S
S
S
F
K
C
A
L
T
K
46
                   
    TM1          
T
G
F
Q
F
Y
Y
L
P
A
56
                   
                   
V
Y
I
L
V
F
I
I
G
F
66
                   
                   
L
G
N
S
V
A
I
W
M
F
76
                   
      ICL1 TM2
V
F
H
M
K
P
W
S
G
I
86
                   
                   
S
V
Y
M
F
N
L
A
L
A
96
                   
                   
D
F
L
Y
V
L
T
L
P
A
106
                   
                   
L
I
F
Y
Y
F
N
K
T
D
116
                   
ECL1 TM3      
W
I
F
G
D
A
M
C
K
L
126
                   
                   
Q
R
F
I
F
H
V
N
L
Y
136
                   
                   
G
S
I
L
F
L
T
C
I
S
146
                   
                   
A
H
R
Y
S
G
V
V
Y
P
156
                   
ICL2       TM4
L
K
S
L
G
R
L
K
K
K
166
                   
                   
N
A
I
C
I
S
V
L
V
W
176
                   
                   
L
I
V
V
V
A
I
S
P
I
186
                   
        ECL2    
L
F
Y
S
G
T
G
V
R
K
196
                   
                   
N
K
T
I
T
C
Y
D
T
T
206
                   
        TM5      
S
D
E
Y
L
R
S
Y
F
I
216
                   
                   
Y
S
M
C
T
T
V
A
M
F
226
                   
                   
C
V
P
L
V
L
I
L
G
C
236
                   
                   
Y
G
L
I
V
R
A
L
I
Y
246
 
 
   
K
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Rubredoxin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
       
TM6  
P
L
R
R
256
                   
                   
K
S
I
Y
L
V
I
I
V
L
266
                   
                   
T
V
F
A
V
S
Y
I
P
F
276
                   
                   
H
V
M
K
T
M
N
L
R
A
286
                   
      ECL3      
R
L
D
F
Q
T
P
A
M
C
296
                   
TM7              
A
F
N
D
R
V
Y
A
T
Y
306
                   
                   
Q
V
T
R
G
L
A
S
L
N
316
     
 
            
                   
S
C
V
N
P
I
L
Y
F
L
326
                   
  H8              
A
G
D
T
F
R
R
R
L
S
336
                   
        C-term
R
A
T
R
K
A
S
R
R
S
346
                   
                   
E
A
N
L
Q
S
K
S
E
D
356
                   
                   
M
T
L
N
I
L
P
E
F
K
366
             
             
Q
N
G
D
T
S
L
373
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreScission
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
 
 
 
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
 
 
TM7
 
H8
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
      
 
  
 
 
TM5 


DIAGRAMS

ICL1 M K P W ICL1ECL1 K T D W I F ECL1ICL2 P L K S L G R L ICL2ECL2 G T G V R K N K T I T C Y D T T S D E Y ECL2ICL3 D L D N S ICL3ECL3 F Q T P A ECL3N-term M T E V L W P A V P N G T D A A F L A G P G S S W G N S T V A S T A A V S S S F K C A L T K T G N-termC-term K A S R R S E A N L Q S K S E D M T L N I L P E F K Q N G D T S L C-term F Q F Y Y L P A V Y I L V F I I G F L G N S V A I W M F V F H S G I S V Y M F N L A L A D F L Y V L T L P A L I F Y Y F N G D A M C K L Q R F I F H V N L Y G S I L F L T C I S A H R Y S G V V Y K K K N A I C I S V L V W L I V V V A I S P I L F Y S L R S Y F I Y S M C T T V A M F C V P L V L I L G C Y G L I V R A L I Y K P L R R K S I Y L V I I V L T V F A V S Y I P F H V M K T M N L R A R L D M C A F N D R V Y A T Y Q V T R G L A S L N S C V D P I L Y F L A G D T L S R F R R R A T R

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
320 |  D N

DELETIONS

  • from 1 to 1
  • from 248 to 252

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: BRIL (b562RIL)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_0 8:8
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: Rubredoxin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 248:252
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: PreScission site (3C)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect pFastBac1

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    additive CHS 0.1 %w/v
    detergent DDM 0.5 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Proteolysis by HRV 3C protease None
    Deglycosylation by PNGase F None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 40-50 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 6.5-6.5

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown Sodium citrate, pH 6.5 0.1 M
    unknown PEG 2000 MME 0-10 % v/v
    unknown ammonium phosphate dibasic 100-300 mM
    Detergent
    detergent DDM 0.05 % w/v
    Lipid
    lipid CHS 0.01 %w/v