apj_human

NAME

5VBL

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

apj_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
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  TM2            
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    ECL1   TM3
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hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
                  
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Rubredoxin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
               
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330
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreScission
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
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C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
 
 
ECL2
 
 
TM5 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Rubred
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
 
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreSci
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 S R E K R ICL1ECL1 Y D W P F ECL1ICL2 P V A N A R L R ICL2ECL2 T T G D L E N T T K V Q C Y M D Y S M V A T V S ECL2ICL3 R K E ICL3ECL3 L H W ECL3N-term M E E G G D F D N Y Y G A D N Q S E C E Y T D W K S S G N-termC-term Q S R C A G T S H S S S G E K S A S Y S S G H S Q G P G P N M G K G G E Q M H E K S I P Y S Q E T L V V D C-term A L I P A I Y M L V F L L G T T G N G L V L W T V F R S R S A D I F I A S L A V A D L T F V V T L P L W A T Y T Y R D G T F F C K L S S Y L I F V N M Y A S V F C L T G L S F D R Y L A I V R L R V S G A V A T A V L W V L A A L L A M P V M V L R S E W A W E V G L G V S S T T V G F V V P F T I M L T C Y F F I A Q T I A G H F R I E G L R K R R R L L S I I V V L V V T F A L C W M P Y H L V K T L Y M L G S L P C D F D L F L M N I F P Y C T C I S Y V N S C L N P F L Y A F F D P R C T S G F R Q A M L C C

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
117 |  V A
177 |  T N
261 |  W K
325 |  C L
326 |  C M

DELETIONS

  • from 1 to 18
  • from 230 to 242
  • from 331 to 380

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: Rubredoxin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 230:242
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: PreScission site
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf21 Insect Bac-to-Bac

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 2.0 %(w/v)
    additive CHS 0.4 %(w/v)

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Proteolysis by TEV protease None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 30-40 mg/ml
    Temperature: 20-22°C
    ph : 6.1-6.1

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Detergent
    detergent DDM 0.01 %(w/v)
    Lipid
    lipid CHS 0.002 %(w/v)
    Additional
    MES pH 6.1 100.0 mM
    PEG500 DME 26.0 %(v/v)
    MgCl2 125.0 mM
    NaCl 100.0 mM
    AMG3054 500.0 mM