glr_human

NAME

5XEZ

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

glr_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
P
P
C
Q
P
Q
R
P
L
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
L
L
L
L
L
L
A
C
Q
20
 
 
 
 
 
 
        
                   
P
Q
V
P
S
A
Q
V
M
D
30
                   
                   
F
L
F
E
K
W
K
L
Y
G
40
                   
                   
D
Q
C
H
H
N
L
S
L
L
50
                   
                   
P
P
P
T
E
L
V
C
N
R
60
                   
                   
T
F
D
K
Y
S
C
W
P
D
70
                   
                   
T
P
A
N
T
T
A
N
I
S
80
                   
                   
C
P
W
Y
L
P
W
H
H
K
90
                   
                   
V
Q
H
R
F
V
F
K
R
C
100
                   
                   
G
P
D
G
Q
W
V
R
G
P
110
                   
                   
R
G
Q
P
W
R
D
A
S
Q
120
                   
                   
C
Q
M
D
G
E
E
I
E
V
130
                   
TM1              
Q
K
E
V
A
K
M
Y
S
S
140
                   
                   
F
Q
V
M
Y
T
V
G
Y
S
150
                   
                   
L
S
L
G
A
L
L
L
A
L
160
                   
            ICL1
A
I
L
G
G
L
S
K
L
H
170
                   
TM2              
C
T
R
N
A
I
H
A
N
L
180
                   
                   
F
A
S
F
V
L
K
A
S
S
190
                   
                   
V
L
V
I
D
G
L
L
R
T
200
                   
      ECL1      
R
Y
S
Q
K
I
G
D
D
L
210
                   
                   
S
V
S
T
W
L
S
D
G
A
220
                   
TM3              
V
A
G
C
R
V
A
A
V
F
230
                   
                   
M
Q
Y
G
I
V
A
N
Y
C
240
                   
                   
W
L
L
V
E
G
L
Y
L
H
250
           
 
 
 
  
          ICL2  
N
L
L
G
L
A
T
L
P
E
260
                   
  TM4            
R
S
F
F
S
L
Y
L
G
I
270
                   
                   
G
W
G
A
P
M
L
F
V
V
280
                   
                   
P
W
A
V
V
K
C
L
F
E
290
                   
ECL2            
N
V
Q
C
W
T
S
N
D
N
300
                   
      TM5        
M
G
F
W
W
I
L
R
F
P
310
                   
                   
V
F
L
A
I
L
I
N
F
F
320
                   
                   
I
F
V
R
I
V
Q
L
L
V
330
                   
          ICL3  
A
K
L
R
A
R
Q
M
H
H
340
                   
  TM6            
T
D
Y
K
F
R
L
A
K
S
350
                   
                   
T
L
T
L
I
P
L
L
G
V
360
                   
                   
H
E
V
V
F
A
F
V
T
D
370
                   
ECL3 TM7      
E
H
A
Q
G
T
L
R
S
A
380
                   
                   
K
L
F
F
D
L
F
L
S
S
390
                   
                   
F
Q
G
L
L
V
A
V
L
Y
400
                   
      H8          
C
F
L
N
K
E
V
Q
S
E
410
                   
                   
L
R
R
R
W
H
R
W
R
L
420
                   
                   
G
K
V
L
W
E
E
R
N
T
430
   
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term        
S
N
H
R
A
S
S
S
P
G
440
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
H
G
P
P
S
K
E
L
Q
F
450
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
R
G
G
G
S
Q
D
S
S
460
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
E
T
P
L
A
G
G
L
P
470
 
 
 
 
 
 
 
             
R
L
A
E
S
P
F
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
                  
  N-term      
 
Q
V
M
D
F
L
F
E
K
35
                   
                   
W
K
L
Y
G
D
Q
C
H
H
45
                   
                   
N
L
S
L
L
P
P
P
T
E
55
                   
                   
L
V
C
N
R
T
F
D
K
Y
65
                   
                   
S
C
W
P
D
T
P
A
N
T
75
                   
                   
T
A
N
I
S
C
P
W
Y
L
85
                   
                   
P
W
H
H
K
V
Q
H
R
F
95
                   
                   
V
F
K
R
C
G
P
D
G
Q
105
                   
                   
W
V
R
G
P
R
G
Q
P
W
115
                   
                   
R
D
A
S
Q
C
Q
M
D
G
125
                   
          TM1    
E
E
I
E
V
Q
K
E
V
A
135
                   
                   
K
M
Y
S
S
F
Q
V
M
Y
145
                   
                   
T
V
G
Y
S
L
S
L
G
A
155
                   
                   
L
L
L
A
L
A
I
L
G
G
165
                   
  ICL1 TM2    
L
S
K
L
H
C
T
R
N
A
175
                   
                   
I
H
A
N
L
F
A
S
F
V
185
                   
                   
L
K
A
S
S
V
L
V
I
D
195
                   
                   
G
L
L
R
T
R
Y
S
Q
K
205
                   
ECL1            
I
G
D
D
L
S
V
S
T
W
215
                   
        TM3      
L
S
D
G
A
V
A
G
C
R
225
                   
                   
V
A
A
V
F
M
Q
Y
G
I
235
                   
                   
V
A
N
Y
C
W
L
L
V
E
245
                   
                   
G
L
Y
L
H
N
L
L
G
L
255
 
 
ICL2
A
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
               
    TM4      
E
R
S
F
F
S
L
Y
267
                   
                   
L
G
I
G
W
G
A
P
M
L
277
                   
                   
F
V
V
P
W
A
V
V
K
C
287
                   
      ECL2      
L
F
E
N
V
Q
C
W
T
S
297
                   
            TM5  
N
D
N
M
G
F
W
W
I
L
307
                   
                   
R
F
P
V
F
L
A
I
L
I
317
                   
                   
N
F
F
I
F
V
R
I
V
Q
327
                   
                   
L
L
V
A
K
L
R
A
R
Q
337
                   
ICL3 TM6      
M
H
H
T
D
Y
K
F
R
L
347
                   
                   
A
K
S
T
L
T
L
I
P
L
357
                   
                   
L
G
V
H
E
V
V
F
A
F
367
                   
      ECL3 TM7
V
T
D
E
H
A
Q
G
T
L
377
                   
                   
R
S
A
K
L
F
F
D
L
F
387
                   
                   
L
S
S
F
Q
G
L
L
V
A
397
                   
            H8    
V
L
Y
C
F
L
N
K
E
V
407
                   
                   
Q
S
E
L
R
R
R
W
H
R
417
                   
                   
W
R
L
G
K
V
L
W
E
E
427
         
 
    C-term
R
N
T
S
N
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreScission
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
 
 
 
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
TM3 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreSci
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG


DIAGRAMS

ICL1 S K L H ICL1ECL1 Q K I G D D L S V S T W L S D G ECL1ICL2 A T L P E R ICL2ECL2 N V Q C W T S N D N M G F ECL2ICL3 R Q M H H T ICL3ECL3 E H A Q ECL3N-term M P P C Q P Q R P L L L L L L L L A C Q P Q V P S A Q V M D F L F E K W K L Y G D Q C H H N L S L L P P P T E L V C N R T F D K Y S C W P D T P A N T T A N I S C P W Y L P W H H K V Q H R F V F K R C G P D G Q W V R G P R G Q P W R D A S Q C Q M D G E E I E V N-termC-term T S N H R A S S S P G H G P P S K E L Q F G R G G G S Q D S S A E T P L A G G L P R L A E S P F C-term Q K E V A K M Y S S F Q V M Y T V G Y S L S L G A L L L A L A I L G G L C T R N A I H A N L F A S F V L K A S S V L V I D G L L R T R Y S A V A G C R V A A V F M Q Y G I V A N Y C W L L V E G L Y L H N L L G L S F F S L Y L G I G W G A P M L F V V P W A V V K C L F E W W I L R F P V F L A I L I N F F I F V R I V Q L L V A K L R A D Y K F R L A K S T L T L I P L L G V H E V V F A F V T D G T L R S A K L F F D L F L S S F Q G L L V A V L Y C F L N K E L R R W R L W E E V Q S E R W H R G K V L R N

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated

DELETIONS

  • from 1 to 26
  • from 257 to 259
  • from 433 to 477

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_1 257:257
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: PreScission site
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_2 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect Bac-to-Bac Baculovirus, pFastBac1

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 4.0 %w/v
    additive CHS 0.8 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Proteolysis by HRV 3C protease None
    Deglycosylation by PNGase F None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 20-30 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 7.0-7.0

    Remarks: mAb1 Fab fragment complex in XFEL + 7.9 MAG was added to absorb the residual precipitant solution

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Detergent
    detergent DDM 0.05 % w/v
    Lipid
    lipid CHS 0.01 %w/v
    Precipitant
    PEG 500DME 20-30 % v/v
    Additional
    HEPES, pH 7.0 100.0 mM
    potassium phosphate monobasic 300.0 mM
    Gly-Gly-Gly 100.0 mM