ptafr_human

NAME

5ZKQ

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

ptafr_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
                  
N-term        
M
E
P
H
D
S
S
H
M
D
10
                   
TM1              
S
E
F
R
Y
T
L
F
P
I
20
                   
                   
V
Y
S
I
I
F
V
L
G
V
30
                   
                   
I
A
N
G
Y
V
L
W
V
F
40
                   
        ICL1    
A
R
L
Y
P
C
K
K
F
N
50
                   
TM2              
E
I
K
I
F
M
V
N
L
T
60
                   
                   
M
A
D
M
L
F
L
I
T
L
70
                   
                   
P
L
W
I
V
Y
Y
Q
N
Q
80
                   
ECL1   TM3    
G
N
W
I
L
P
K
F
L
C
90
                   
                   
N
V
A
G
C
L
F
F
I
N
100
                   
                   
T
Y
C
S
V
A
F
L
G
V
110
         
 
        
                   
I
T
Y
N
R
F
Q
A
V
T
120
                   
  ICL2          
R
P
I
K
T
A
Q
A
N
T
130
                   
TM4              
R
K
R
G
I
S
L
S
L
V
140
                   
                   
I
W
V
A
I
V
G
A
A
S
150
                   
          ECL2  
Y
F
L
I
L
D
S
T
N
T
160
               
 
  
                   
V
P
D
S
A
G
S
G
N
V
170
                   
                   
T
R
C
F
E
H
Y
E
K
G
180
                   
TM5              
S
V
P
V
L
I
I
H
I
F
190
                   
                   
I
V
F
S
F
F
L
V
F
L
200
                   
                   
I
I
L
F
C
N
L
V
I
I
210
               
 
 
            ICL3
R
T
L
L
M
Q
P
V
Q
Q
220
 
 
 
            
 
TM6              
Q
R
N
A
E
V
K
R
R
A
230
     
 
            
                   
L
W
M
V
C
T
V
L
A
V
240
                   
                   
F
I
I
C
F
V
P
H
H
V
250
                   
                   
V
Q
L
P
W
T
L
A
E
L
260
                   
  ECL3 TM7    
G
F
Q
D
S
K
F
H
Q
A
270
                   
                   
I
N
D
A
H
Q
V
T
L
C
280
               
 
  
                   
L
L
S
T
N
C
V
L
D
P
290
                   
                   
V
I
Y
C
F
L
T
K
K
F
300
                   
H8                
R
K
H
L
T
E
K
F
Y
S
310
           
 
 
 
 
      C-term  
M
R
S
S
R
K
C
S
R
A
320
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
T
D
T
V
T
E
V
V
V
330
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
P
F
N
Q
I
P
G
N
S
L
340
 
 
   
K
N
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Expression
 
                  
  N-term      
 
E
P
H
D
S
S
H
M
D
10
                   
TM1              
S
E
F
R
Y
T
L
F
P
I
20
                   
                   
V
Y
S
I
I
F
V
L
G
V
30
                   
                   
I
A
N
G
Y
V
L
W
V
F
40
                   
        ICL1    
A
R
L
Y
P
C
K
K
F
N
50
                   
TM2              
E
I
K
I
F
M
V
N
L
T
60
                   
                   
M
A
D
M
L
F
L
I
T
L
70
                   
                   
P
L
W
I
V
Y
Y
Q
N
Q
80
                   
ECL1   TM3    
G
N
W
I
L
P
K
F
L
C
90
                   
                   
N
V
A
G
C
L
F
F
I
N
100
                   
                   
T
Y
C
S
V
A
F
L
G
V
110
         
 
        
                   
I
T
Y
N
R
Y
Q
A
V
T
120
                   
  ICL2          
R
P
I
K
T
A
Q
A
N
T
130
                   
TM4              
R
K
R
G
I
S
L
S
L
V
140
                   
                   
I
W
V
A
I
V
G
A
A
S
150
                   
          ECL2  
Y
F
L
I
L
D
S
T
N
T
160
               
 
  
                   
V
P
D
S
A
G
S
G
D
V
170
                   
                   
T
R
C
F
E
H
Y
E
K
G
180
                   
TM5              
S
V
P
V
L
I
I
H
I
F
190
                   
                   
I
V
F
S
F
F
L
V
F
L
200
                   
                   
I
I
L
F
C
N
L
V
I
I
210
               
 
            ICL3
R
T
L
L
M
Q
P
V
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
           
 
  
TM6          
A
E
V
K
R
R
D
L
231
   
 
              
                   
W
M
A
C
T
V
L
A
V
F
241
                   
                   
I
I
C
F
V
P
H
H
V
V
251
                   
                   
Q
L
P
W
T
L
A
E
L
G
261
                   
ECL3 TM7      
F
Q
D
S
K
F
H
Q
A
I
271
                   
                   
N
D
A
H
Q
V
T
L
C
L
281
             
 
    
                   
L
S
T
N
C
V
L
N
P
V
291
                   
                H8
I
Y
C
F
L
T
K
K
F
R
301
                   
                   
K
H
L
T
E
K
F
Y
S
M
311
         
 
    C-term
R
S
S
R
K
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Expression

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
 
 
ECL2
 
TM5
 
 
 
ICL3
 
 
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
 
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Expres
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
 
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
 
 
ECL2
 
TM5
 
 
ICL3 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
 
 
 
 
TM6
 
ECL3
 
 
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Expres


DIAGRAMS

ICL1 P C K K ICL1ECL1 G N W I L ECL1ICL2 P I K T A Q A N ICL2ECL2 D S T N T V P D S A G S G N V T R C F E H Y E K G ECL2ICL3 P V Q Q ICL3ECL3 F Q ECL3N-term M E P H D S S H M N-termC-term S R K C S R A T T D T V T E V V V P F N Q I P G N S L K N C-term D S E F R Y T L F P I V Y S I I F V L G V I A N G Y V L W V F A R L Y F N E I K I F M V N L T M A D M L F L I T L P L W I V Y Y Q N Q P K F L C N V A G C L F F I N T Y C S V A F L G V I T Y N R F Q A V T R T R K R G I S L S L V I W V A I V G A A S Y F L I L S V P V L I I H I F I V F S F F L V F L I I L F C N L V I I R T L L M Q Q R N A E V K R R A L W M V C T V L A V F I I C F V P H H V V Q L P W T L A E L G D S K F H Q A I N D A H Q V T L C L L S T N C V L D P V I Y C F L T K K F R K K F Y H L T E S M R S

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
116 |  F Y
169 |  N D
230 |  A D
234 |  V A
289 |  D N

DELETIONS

  • from 1 to 1
  • from 219 to 223
  • from 317 to 342

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: auto

    Name: Expression tag
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_2 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: auto

    Name: Expression tag
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_1 219:219
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description

    Remarks:

    CRYSTALLIZATION

    METHOD:
    TYPE: ()
    PROTEIN CONCENTRATION:
    Temperature:
    ph : -

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration