5ht2c_human

NAME

6BQG

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

5ht2c_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
V
N
L
R
N
A
V
H
S
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
F
L
V
H
L
I
G
L
L
V
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
W
Q
S
D
I
S
V
S
P
V
30
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  
                   
A
A
I
V
T
D
I
F
N
T
40
                   
                   
S
D
G
G
R
F
K
F
P
D
50
                   
      TM1        
G
V
Q
N
W
P
A
L
S
I
60
                   
                   
V
I
I
I
I
M
T
I
G
G
70
                   
                   
N
I
L
V
I
M
A
V
S
M
80
                   
  ICL1 TM2    
E
K
K
L
H
N
A
T
N
Y
90
                   
                   
F
L
M
S
L
A
I
A
D
M
100
                   
                   
L
V
G
L
L
V
M
P
L
S
110
                   
                   
L
L
A
I
L
Y
D
Y
V
W
120
                   
ECL1 TM3      
P
L
P
R
Y
L
C
P
V
W
130
                   
                   
I
S
L
D
V
L
F
S
T
A
140
                   
                   
S
I
M
H
L
C
A
I
S
L
150
                   
                   
D
R
Y
V
A
I
R
N
P
I
160
                   
ICL2     TM4  
E
H
S
R
F
N
S
R
T
K
170
                   
                   
A
I
M
K
I
A
I
V
W
A
180
                   
                   
I
S
I
G
V
S
V
P
I
P
190
                   
            ECL2
V
I
G
L
R
D
E
E
K
V
200
                   
                   
F
V
N
N
T
T
C
V
L
N
210
                   
TM5              
D
P
N
F
V
L
I
G
S
F
220
                   
                   
V
A
F
F
I
P
L
T
I
M
230
                   
                   
V
I
T
Y
C
L
T
I
Y
V
240
         
 
 
 
 
 
                   
L
R
R
Q
A
L
M
L
L
H
250
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
ICL3            
G
H
T
E
E
P
P
G
L
S
260
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
D
F
L
K
C
C
K
R
N
270
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
A
E
E
E
N
S
A
N
P
280
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
N
Q
D
Q
N
A
R
R
R
K
290
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
K
E
R
R
P
R
G
T
M
300
                   
TM6              
Q
A
I
N
N
E
R
K
A
S
310
                   
                   
K
V
L
G
I
V
F
F
V
F
320
                   
                   
L
I
M
W
C
P
F
F
I
T
330
                   
                   
N
I
L
S
V
L
C
E
K
S
340
                   
ECL3 TM7      
C
N
Q
K
L
M
E
K
L
L
350
                 
 
                   
N
V
F
V
W
I
G
Y
V
C
360
                   
                   
S
G
I
N
P
L
V
Y
T
L
370
                   
  H8              
F
N
K
I
Y
R
R
A
F
S
380
                   
                   
N
Y
L
R
C
N
Y
K
V
E
390
     
 
 
 
 
 
 
 
C-term        
K
K
P
P
V
R
Q
I
P
R
400
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
A
A
T
A
L
S
G
R
E
410
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
N
V
N
I
Y
R
H
T
N
420
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
P
V
I
E
K
A
S
D
N
430
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
P
G
I
E
M
Q
V
E
N
440
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
E
L
P
V
N
P
S
S
V
450
 
 
 
 
 
 
 
 
               
V
S
E
R
I
S
S
V
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
                  
  N-term      
 
T
S
D
G
G
R
F
K
F
48
                   
          TM1    
P
D
G
V
Q
N
W
P
A
L
58
                   
                   
S
I
V
I
I
I
I
M
T
I
68
                   
                   
G
G
N
I
L
V
I
M
A
V
78
                   
      ICL1 TM2
S
M
E
K
K
L
H
N
A
T
88
                   
                   
N
Y
F
L
M
S
L
A
I
A
98
                   
                   
D
M
L
V
G
L
L
V
M
P
108
                   
                   
L
S
L
L
A
I
L
Y
D
Y
118
                   
ECL1 TM3      
V
W
P
L
P
R
Y
L
C
P
128
                   
                   
V
W
I
S
L
D
V
L
F
S
138
                   
                   
T
A
S
I
M
H
L
C
A
I
148
                   
                   
S
L
D
R
Y
V
A
I
R
N
158
                   
ICL2            
P
I
E
H
S
R
F
N
S
R
168
                   
TM4              
T
K
A
I
M
K
I
A
I
V
178
                   
                   
W
A
I
S
I
G
V
S
V
P
188
                   
                   
I
P
V
I
G
L
R
D
E
E
198
                   
ECL2            
K
V
F
V
N
N
T
T
C
V
208
                   
    TM5          
L
N
D
P
N
F
V
L
I
G
218
                   
                   
S
F
V
A
F
F
I
P
L
T
228
                   
                   
I
M
V
I
T
Y
C
L
T
I
238
             
 
    
                   
Y
V
L
R
R
Q
A
 
Q
A
302
                   
TM6              
I
N
N
E
R
K
A
S
K
V
312
                   
                   
L
G
I
V
F
F
V
F
L
I
322
                   
                   
M
W
C
P
F
F
I
T
N
I
332
                   
          ECL3  
L
S
V
L
C
E
K
S
C
N
342
                   
TM7              
Q
K
L
M
E
K
L
L
N
V
352
             
 
    
                   
F
V
W
I
G
Y
V
N
S
G
362
                   
                   
I
N
P
L
V
Y
T
L
F
N
372
                   
H8                
K
I
Y
R
R
A
F
S
N
Y
382
                   
      C-term  
L
R
C
N
Y
K
V
E
K
K
392
 
 
   
P
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreScission
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
 
 
TM5
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
ICL3
 
 
TM6
 
ECL3
 
 
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
 
TM5 
 
 
TM6
 
ECL3
 
 
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PreSci
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 K K L H ICL1ECL1 Y V W P L ECL1ICL2 P I E H S R F N ICL2ECL2 E E K V F V N N T T C V L N ECL2ICL3 G H T E E P P G L S L D F L K C C K R N T A E E E N S A N P N Q D Q N A R R R K K K E R R P R G T ICL3ECL3 E K S C ECL3N-term M V N L R N A V H S F L V H L I G L L V W Q S D I S V S P V A A I V T D I F N T S D G G R F K F P D G V Q N-termC-term N Y K V E K K P P V R Q I P R V A A T A L S G R E L N V N I Y R H T N E P V I E K A S D N E P G I E M Q V E N L E L P V N P S S V V S E R I S S V C-term N W P A L S I V I I I I M T I G G N I L V I M A V S M E N A T N Y F L M S L A I A D M L V G L L V M P L S L L A I L Y D P R Y L C P V W I S L D V L F S T A S I M H L C A I S L D R Y V A I R N S R T K A I M K I A I V W A I S I G V S V P I P V I G L R D D P N F V L I G S F V A F F I P L T I M V I T Y C L T I Y V L R R Q A L M L L H M Q A I N N E R K A S K V L G I V F F V F L I M W C P F F I T N I L S V L C N Q K L M E K L L N V F V W I G Y V C S G I N P L V Y T L F N K I F S N Y R R A Y L R C

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
360 |  C N

DELETIONS

  • from 1 to 39
  • from 246 to 300
  • from 394 to 458

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: BRIL (b562RIL)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_2 247:300
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: PreScission site (3C)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect Bac - to - Bac Baculovirus Expression System (Invitrogen)

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1 %w/v
    additive CHS 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 30.0 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 6.0-6.0

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Detergent
    Detergent DDM 0.02 %v/v
    Lipid
    Lipid CHS 0.004 %v/v
    Additional
    Salt (NH4)2SO4 80-120 mM
    Buffer sodium citrate pH 6.0 0.1 M
    Precipitant
    precipitant PEG 400 25–32 %v/v