c5ar1_human

NAME

6C1Q

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

c5ar1_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
D
S
F
N
Y
T
T
P
D
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Y
G
H
Y
D
D
K
D
T
L
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  
                   
D
L
N
T
P
V
D
K
T
S
30
                   
      TM1        
N
T
L
R
V
P
D
I
L
A
40
                   
                   
L
V
I
F
A
V
V
F
L
V
50
                   
                   
G
V
L
G
N
A
L
V
V
W
60
                   
          ICL1  
V
T
A
F
E
A
K
R
T
I
70
                   
TM2              
N
A
I
W
F
L
N
L
A
V
80
                   
                   
A
D
F
L
S
C
L
A
L
P
90
                   
                   
I
L
F
T
S
I
V
Q
H
H
100
                   
ECL1 TM3      
H
W
P
F
G
G
A
A
C
S
110
                   
                   
I
L
P
S
L
I
L
L
N
M
120
                   
                   
Y
A
S
I
L
L
L
A
T
I
130
                   
                   
S
A
D
R
F
L
L
V
F
K
140
                   
ICL2            
P
I
W
C
Q
N
F
R
G
A
150
                   
TM4              
G
L
A
W
I
A
C
A
V
A
160
                   
                   
W
G
L
A
L
L
L
T
I
P
170
                   
          ECL2  
S
F
L
Y
R
V
V
R
E
E
180
                   
                   
Y
F
P
P
K
V
L
C
G
V
190
                   
        TM5      
D
Y
S
H
D
K
R
R
E
R
200
                   
                   
A
V
A
I
V
R
L
V
L
G
210
                   
                   
F
L
W
P
L
L
T
L
T
I
220
                   
                   
C
Y
T
F
I
L
L
R
T
W
230
                   
    ICL3   TM6
S
R
R
A
T
R
S
T
K
T
240
                   
                   
L
K
V
V
V
A
V
V
A
S
250
                   
                   
F
F
I
F
W
L
P
Y
Q
V
260
                   
                   
T
G
I
M
M
S
F
L
E
P
270
                   
ECL3 TM7      
S
S
P
T
F
L
L
L
K
K
280
                   
                   
L
D
S
L
C
V
S
F
A
Y
290
                   
                   
I
N
C
C
I
N
P
I
I
Y
300
                   
        H8        
V
V
A
G
Q
G
F
Q
G
R
310
                   
        C-term
L
R
K
S
L
P
S
L
L
R
320
                 
 
                   
N
V
L
T
E
E
S
V
V
R
330
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
S
K
S
F
T
R
S
T
V
340
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
D
T
M
A
Q
K
T
Q
A
V
350
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
BRIL (b562R
 
                  
  N-term TM1
 
S
N
T
L
R
V
P
D
I
38
                   
                   
L
A
L
V
I
F
A
V
V
F
48
                   
                   
L
V
G
V
L
G
N
A
L
V
58
                   
                   
V
W
V
T
A
F
E
A
K
R
68
                   
TM2              
T
I
N
A
I
W
F
L
N
L
78
                   
                   
A
V
A
D
F
L
S
C
L
A
88
                   
                   
L
P
I
L
F
T
S
I
V
Q
98
                   
  ECL1   TM3  
H
H
H
W
P
F
G
G
A
A
108
                   
                   
C
S
I
L
P
S
L
I
L
L
118
                   
                   
N
M
Y
A
S
I
L
L
L
A
128
                   
                   
T
I
S
A
D
R
F
L
L
V
138
                   
    ICL2        
F
K
P
I
W
C
Q
N
F
R
148
                   
TM4              
G
A
G
L
A
W
I
A
C
A
158
                   
                   
V
A
W
G
L
A
L
L
L
T
168
                   
                   
I
P
S
F
L
Y
R
V
V
R
178
                   
ECL2            
E
E
Y
F
P
P
K
V
L
C
188
                   
            TM5  
G
V
D
Y
S
H
D
K
R
R
198
                   
                   
E
R
A
V
A
I
V
R
L
V
208
                   
                   
L
G
F
L
W
P
L
L
T
L
218
                   
                   
T
I
C
Y
T
F
I
L
L
R
228
                   
        ICL3    
T
W
S
R
R
A
T
R
S
T
238
                   
TM6              
K
T
L
K
V
V
V
A
V
V
248
                   
                   
A
S
F
F
I
F
W
L
P
Y
258
                   
                   
Q
V
T
G
I
M
M
S
F
L
268
                   
ECL3 TM7      
E
P
S
S
P
T
F
L
L
L
278
                   
                   
K
K
L
D
S
L
C
V
S
F
288
                   
                   
A
Y
I
N
C
C
I
N
P
I
298
                   
            H8    
I
Y
V
V
A
G
Q
G
F
Q
308
                   
                   
G
R
L
R
K
S
L
P
S
L
318
                   
C-term        
L
R
N
V
L
T
E
E
S
V
328
 
 
V
329
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV proteas
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  
 
     
R
E
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(8)        

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
BRIL (
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV pr


DIAGRAMS

ICL1 A K R ICL1ECL1 H H W P F ECL1ICL2 P I W C Q N F R ICL2ECL2 V V R E E Y F P P K V L C G V D Y S H ECL2ICL3 R A T R S ICL3ECL3 E P S ECL3N-term M D S F N Y T T P D Y G H Y D D K D T L D L N T P V D K T S N T L N-termC-term L P S L L R N V L T E E S V V R E S K S F T R S T V D T M A Q K T Q A V C-term R V P D I L A L V I F A V V F L V G V L G N A L V V W V T A F E T I N A I W F L N L A V A D F L S C L A L P I L F T S I V Q H G G A A C S I L P S L I L L N M Y A S I L L L A T I S A D R F L L V F K G A G L A W I A C A V A W G L A L L L T I P S F L Y R D K R R E R A V A I V R L V L G F L W P L L T L T I C Y T F I L L R T W S R T K T L K V V V A V V A S F F I F W L P Y Q V T G I M M S F L S P T F L L L K K L D S L C V S F A Y I N C C I N P I I Y V V A G Q G F R K S Q G R L

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated

DELETIONS

  • from 1 to 29
  • from 332 to 350

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: BRIL (b562RIL)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: TEV protease
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_0 330:330
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(8)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect Bac - to - Bac Baculovirus Expression System (Invitrogen)

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1 %w/v
    additive CHS 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Proteolysis by TEV protease None
    Detergent DDM exchanged with LMNG None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 40-50 mg/ml
    Temperature: 10°C
    ph : 6.5-6.5

    Remarks: Crystals grew only at 10°C and not at 20°C

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Detergent
    LMNG 0.01 % w/v
    Lipid
    CHS 0.001 % w/v
    Additional
    PEG 300 25-32 % v/v
    MES, pH 6.5 100.0 mM
    Sodium malonate 90-120 mM
    Polypropylene glycol P400 0.5-1 %