agrd1_human

NAME

7WU2

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

agrd1_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
E
K
L
L
R
L
C
C
W
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Y
S
W
L
L
L
F
Y
Y
N
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
F
Q
V
R
G
V
Y
S
R
S
30
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Q
D
H
P
G
F
Q
V
L
A
40
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
A
S
H
Y
W
P
L
E
N
50
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
D
G
I
H
E
L
Q
D
T
60
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
G
D
I
V
E
G
K
V
N
70
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
G
I
Y
L
K
E
E
K
G
80
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
T
L
L
Y
Y
G
R
Y
N
90
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
S
C
I
S
K
P
E
Q
C
100
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
P
E
G
V
T
F
S
F
F
110
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
W
K
T
Q
G
E
Q
S
R
P
120
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
P
S
A
Y
G
G
Q
V
I
130
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
N
G
F
K
V
C
S
S
G
140
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
R
G
S
V
E
L
Y
T
R
150
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
D
N
S
M
T
W
E
A
S
F
160
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
P
P
G
P
Y
W
T
H
V
170
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
F
T
W
K
S
K
E
G
L
180
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
V
Y
V
N
G
T
L
S
T
190
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
D
P
S
G
K
V
S
R
D
200
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Y
G
E
S
N
V
N
L
V
I
210
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
S
E
Q
D
Q
A
K
C
Y
220
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
E
N
G
A
F
D
E
F
I
I
230
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
W
E
R
A
L
T
P
D
E
I
240
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
M
Y
F
T
A
A
I
G
K
250
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
H
A
L
L
S
S
T
L
P
S
260
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
F
M
T
S
T
A
S
P
V
270
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
          A.H2  
M
P
T
D
A
Y
H
P
I
I
280
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
N
L
T
E
E
R
K
T
F
290
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
A.h2h3 A.H3
Q
S
P
G
V
I
L
S
Y
L
300
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Q
N
V
S
L
S
L
P
S
K
310
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
A.h3h4 A.H4
S
L
S
E
Q
T
A
L
N
L
320
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
T
K
T
F
L
K
A
V
G
E
330
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
    A.h4h5 A.H5
I
L
L
L
P
G
W
I
A
L
340
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
A.h5h6 A.H6
S
E
D
S
A
V
V
L
S
L
350
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
               
I
D
T
I
D
T
V
M
G
H
360
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
        A.h6s1
V
S
S
N
L
H
G
S
T
P
370
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  B.S1          
Q
V
T
V
E
G
S
S
A
M
380
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.S2            
A
E
F
S
V
A
K
I
L
P
390
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.s2s3 B.S3
K
T
V
N
S
S
H
Y
R
F
400
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.s3s4 B.S5
P
A
H
G
Q
S
F
I
Q
I
410
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  B.s5s6      
P
H
E
A
F
H
R
H
A
W
420
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.S6            
S
T
V
V
G
L
L
Y
H
S
430
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.s6s7        
M
H
Y
Y
L
N
N
I
W
P
440
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
H
T
K
I
A
E
A
M
H
450
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
          B.S7  
H
Q
D
C
L
L
F
A
T
S
460
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.s7s8 B.S8
H
L
I
S
L
E
V
S
P
P
470
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.s8s9        
P
T
L
S
Q
N
L
S
G
S
480
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
    B.S9        
P
L
I
T
V
H
L
K
H
R
490
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.s9s10      
L
T
R
K
Q
H
S
E
A
T
500
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
      B.S10    
N
S
S
N
R
V
F
V
Y
C
510
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
F
L
D
F
S
S
G
E
G
520
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.S11          
V
W
S
N
H
G
C
A
L
T
530
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
B.s12s13 B.S13
R
G
N
L
T
Y
S
V
C
R
540
 
 
 
 
            
B.s13gps B.GPS B.S14
C
T
H
L
T
N
F
A
I
L
550
                   
M
Q
V
V
P
L
E
L
A
R
560
                   
TM1            
G
H
Q
V
A
L
S
S
I
S
570
                   
                   
Y
V
G
C
S
L
S
V
L
C
580
                   
                   
L
V
A
T
L
V
T
F
A
V
590
                   
        ICL1    
L
S
S
V
S
T
I
R
N
Q
600
                   
TM2              
R
Y
H
I
H
A
N
L
S
F
610
                   
                   
A
V
L
V
A
Q
V
L
L
L
620
                   
          ECL1  
I
S
F
R
L
E
P
G
T
T
630
                   
TM3              
P
C
Q
V
M
A
V
L
L
H
640
                   
                   
Y
F
F
L
S
A
F
A
W
M
650
                   
                   
L
V
E
G
L
H
L
Y
S
M
660
                   
      ICL2      
V
I
K
V
F
G
S
E
D
S
670
                   
TM4              
K
H
R
Y
Y
Y
G
M
G
W
680
                   
                   
G
F
P
L
L
I
C
I
I
S
690
                   
        ECL2    
L
S
F
A
M
D
S
Y
G
T
700
                   
                   
S
N
N
C
W
L
S
L
A
S
710
                   
TM5              
G
A
I
W
A
F
V
A
P
A
720
                   
                   
L
F
V
I
V
V
N
I
G
I
730
                   
                   
L
I
A
V
T
R
V
I
S
Q
740
                   
                   
I
S
A
D
N
Y
K
I
H
G
750
                   
TM6              
D
P
S
A
F
K
L
T
A
K
760
                   
                   
A
V
A
V
L
L
P
I
L
G
770
                   
                   
T
S
W
V
F
G
V
L
A
V
780
                   
ECL3 TM7      
N
G
C
A
V
V
F
Q
Y
M
790
                   
                   
F
A
T
L
N
S
L
Q
G
L
800
                   
                   
F
I
F
L
F
H
C
L
L
N
810
                   
H8                
S
E
V
R
A
A
F
K
H
K
820
             
 
 
 
                   
T
K
V
W
S
L
T
S
S
S
830
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term        
A
R
T
S
N
A
K
P
F
H
840
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
D
L
M
N
G
T
R
P
G
850
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
M
A
S
T
K
L
S
P
W
D
860
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
S
S
H
S
A
H
R
V
D
870
 
 
 
 
       
L
S
A
V
 
                  
  B.GPS B.S14
 
T
N
F
A
I
L
M
Q
V
553
                   
  B.s14tm1 TM1
V
P
L
E
L
A
R
G
H
Q
563
                   
             
V
A
L
S
S
I
S
Y
V
G
573
                   
                   
C
S
L
S
V
L
C
L
V
A
583
                   
                   
T
L
V
T
F
A
V
L
S
S
593
                   
  ICL1 TM2    
V
S
T
I
R
N
Q
R
Y
H
603
                   
                   
I
H
A
N
L
S
F
A
V
L
613
                   
                   
V
A
Q
V
L
L
L
I
S
F
623
                   
    ECL1 TM3  
R
L
E
P
G
T
T
P
C
Q
633
                   
                   
V
M
A
V
L
L
H
Y
F
F
643
                   
                   
L
S
A
F
A
W
M
L
V
E
653
                   
                   
G
L
H
L
Y
S
M
V
I
K
663
                   
ICL2       TM4
V
F
G
S
E
D
S
K
H
R
673
                   
                   
Y
Y
Y
G
M
G
W
G
F
P
683
                   
                   
L
L
I
C
I
I
S
L
S
F
693
                   
  ECL2          
A
M
D
S
Y
G
T
S
N
N
703
                   
              TM5
C
W
L
S
L
A
S
G
A
I
713
                   
                   
W
A
F
V
A
P
A
L
F
V
723
                   
                   
I
V
V
N
I
G
I
L
I
A
733
                   
                   
V
T
R
V
I
S
Q
I
S
A
743
                   
        ICL3 TM6
D
N
Y
K
I
H
G
D
P
S
753
                   
                 
A
F
K
L
T
A
K
A
V
A
763
                   
                   
V
L
L
P
I
L
G
T
S
W
773
                   
                   
V
F
G
V
L
A
V
N
G
C
783
                   
TM7              
A
V
V
F
Q
Y
M
F
A
T
793
                   
                   
L
N
S
L
Q
G
L
F
I
F
803
                   
            H8    
L
F
H
C
L
L
N
S
E
V
813
                   
                   
R
A
A
F
K
H
K
T
K
V
823
       
 
      C-term
W
S
L
T
 

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term

      
 
  
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
H8 


DIAGRAMS

ICL1 S T I R ICL1ECL1 E P G ECL1ICL2 V F G S E D S ICL2ECL2 M D S Y G T S N N C W L S L A S ECL2ICL3 I H G ICL3ECL3 N G ECL3N-term M E K L L R L C C W Y S W L L L F Y Y N F Q V R G V Y S R S Q D H P G F Q V L A S A S H Y W P L E N V D G I H E L Q D T T G D I V E G K V N K G I Y L K E E K G V T L L Y Y G R Y N S S C I S K P E Q C G P E G V T F S F F W K T Q G E Q S R P I P S A Y G G Q V I S N G F K V C S S G G R G S V E L Y T R D N S M T W E A S F S P P G P Y W T H V L F T W K S K E G L K V Y V N G T L S T S D P S G K V S R D Y G E S N V N L V I G S E Q D Q A K C Y E N G A F D E F I I W E R A L T P D E I A M Y F T A A I G K H A L L S S T L P S L F M T S T A S P V M P T D A N-termC-term T S S S A R T S N A K P F H S D L M N G T R P G M A S T K L S P W D K S S H S A H R V D L S A V C-term A R G H Q V A L S S I S Y V G C S L S V L C L V A T L V T F A V L S S V N Q R Y H I H A N L S F A V L V A Q V L L L I S F R L T T P C Q V M A V L L H Y F F L S A F A W M L V E G L H L Y S M V I K K H R Y Y Y G M G W G F P L L I C I I S L S F A G A I W A F V A P A L F V I V V N I G I L I A V T R V I S Q I S A D N Y K D P S A F K L T A K A V A V L L P I L G T S W V F G V L A V C A V V F Q Y M F A T L N S L Q G L F I F L F H C L L N S E F K H W S L V R A A K T K V

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated

DELETIONS

  • from 1 to 544
  • from 828 to 874

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS


    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description

    Remarks:

    CRYSTALLIZATION

    METHOD:
    TYPE: ()
    PROTEIN CONCENTRATION:
    Temperature:
    ph : -

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration