q76sf8_hhv8

NAME

8K4P

ORGANISM

HHV-8 (Human herpesvirus 8)

PROTEIN NAME

q76sf8_hhv8

SOURCE

TREMBL

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
A
A
E
D
F
L
T
I
F
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
D
D
D
E
S
W
N
E
T
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
N
M
S
G
Y
D
Y
S
G
30
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
N
F
S
L
E
V
S
V
C
E
40
 
 
 
 
 
 
       
          TM1    
M
T
T
V
V
P
Y
T
W
N
50
                   
                   
V
G
I
L
S
L
I
F
L
I
60
                   
                   
N
V
L
G
N
G
L
V
T
Y
70
                   
                   
I
F
C
K
H
R
S
R
A
G
80
                   
TM2              
A
I
D
I
L
L
L
G
I
C
90
                   
                   
L
N
S
L
C
L
S
I
S
L
100
                   
                   
L
A
E
V
L
M
F
L
F
P
110
                   
ECL1 TM3      
N
I
I
S
T
G
L
C
R
L
120
                   
                   
E
I
F
F
Y
Y
L
Y
V
Y
130
                   
                   
L
D
I
F
S
V
V
C
V
S
140
                   
                   
L
V
R
Y
L
L
V
A
Y
S
150
                   
ICL2     TM4  
T
R
S
W
P
K
K
Q
S
L
160
                   
                   
G
W
V
L
T
S
A
A
L
L
170
                   
                   
I
A
L
V
L
S
G
D
A
C
180
                   
  ECL2          
R
H
R
S
R
V
V
D
P
V
190
                   
                   
S
K
Q
A
M
C
Y
E
N
A
200
                   
TM5              
G
N
M
T
A
D
W
R
L
H
210
                   
                   
V
R
T
V
S
V
T
A
G
F
220
                   
                   
L
L
P
L
A
L
L
I
L
F
230
                   
                   
Y
A
L
T
W
C
V
V
R
R
240
                   
  ICL3 TM6    
T
K
L
Q
A
R
R
K
V
R
250
                   
                   
G
V
I
V
A
V
V
L
L
F
260
                   
                   
F
V
F
C
F
P
Y
H
V
L
270
                   
                   
N
L
L
D
T
L
L
R
R
R
280
                   
ECL3 TM7      
W
I
R
D
S
C
Y
T
R
G
290
                   
                   
L
I
N
V
G
L
A
V
T
S
300
                   
                   
L
L
Q
A
L
Y
S
A
V
V
310
                   
                H8
P
L
I
Y
S
C
L
G
S
L
320
                   
                   
F
R
Q
R
M
Y
G
L
F
Q
330
                   
                   
S
L
R
Q
S
F
M
S
G
A
340
 
 
C-term
T
T
 
                 
  TM1            
 
Y
T
W
N
V
G
I
L
S
55
                   
                   
L
I
F
L
I
N
V
L
G
N
65
                   
                   
G
L
V
T
Y
I
F
C
K
H
75
                   
        TM2      
R
S
R
A
G
A
I
D
I
L
85
                   
                   
L
L
G
I
C
L
N
S
L
C
95
                   
                   
L
S
I
S
L
L
A
E
V
L
105
                   
        ECL1    
M
F
L
F
P
N
I
I
S
T
115
                   
TM3              
G
L
C
R
L
E
I
F
F
Y
125
                   
                   
Y
L
Y
V
Y
L
D
I
F
S
135
                   
                   
V
V
C
V
S
L
V
R
Y
L
145
                   
        ICL2    
L
V
A
Y
S
T
R
S
W
P
155
                   
  TM4            
K
K
Q
S
L
G
W
V
L
T
165
                   
                   
S
A
A
L
L
I
A
L
V
L
175
                   
            ECL2
S
G
D
A
C
R
H
R
S
R
185
                   
                   
V
V
D
P
V
S
K
Q
A
M
195
                   
        TM5      
C
Y
E
N
A
G
N
M
T
A
205
                   
                   
D
W
R
L
H
V
R
T
V
S
215
                   
                   
V
T
A
G
F
L
L
P
L
A
225
                   
                   
L
L
I
L
F
Y
A
L
T
W
235
                   
            ICL3
C
V
V
R
R
T
K
L
Q
A
245
                   
TM6              
R
R
K
V
R
G
V
I
V
A
255
                   
                   
V
V
L
L
F
F
V
F
C
F
265
                   
                   
P
Y
H
V
L
N
L
L
D
T
275
                   
        ECL3    
L
L
R
R
R
W
I
R
D
S
285
                   
TM7              
C
Y
T
R
G
L
I
N
V
G
295
                   
                   
L
A
V
T
S
L
L
Q
A
L
305
                   
                   
Y
S
A
V
V
P
L
I
Y
S
315
                   
      H8          
C
L
G
S
L
F
R
Q
R
M
325
                   
                   
Y
G
L
F
Q
S
L
R
Q
S
335
         
 
           
F
M
S
G
A
 

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
 
TM1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
C-term

 
 
 
 TM1
 
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
 
H8 


DIAGRAMS

ECL1 P N I I ECL1ICL2 S T R S W P K ICL2ECL2 H R S R V V D P V S K Q A M C Y E N ECL2ICL3 K L Q ICL3ECL3 R W I R D ECL3N-term M A A E D F L T I F L D D D E S W N E T L N M S G Y D Y S G N F S L E V S V C E M T T V V N-termC-term T T C-term P Y T W N V G I L S L I F L I N V L G N G L V T Y I F C K H R S R A G A I D I L L L G I C L N S L C L S I S L L A E V L M F L F S T G L C R L E I F F Y Y L Y V Y L D I F S V V C V S L V R Y L L V A Y K Q S L G W V L T S A A L L I A L V L S G D A C R A G N M T A D W R L H V R T V S V T A G F L L P L A L L I L F Y A L T W C V V R R T A R R K V R G V I V A V V L L F F V F C F P Y H V L N L L D T L L R R S C Y T R G L I N V G L A V T S L L Q A L Y S A V V P L I Y S C L G S L F Y G L R Q S A R Q R M F Q S L F M S G

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated

DELETIONS

  • from 1 to 46
  • from 341 to 342

  • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS


    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description

    Remarks:

    CRYSTALLIZATION

    METHOD:
    TYPE: ()
    PROTEIN CONCENTRATION:
    Temperature:
    ph : -

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration