gpc5d_human

NAME

8YZK

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

gpc5d_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

                   
N-term        
M
Y
K
D
C
I
E
S
T
G
10
                   
                   
D
Y
F
L
L
C
D
A
E
G
20
                   
  TM1            
P
W
G
I
I
L
E
S
L
A
30
                   
                   
I
L
G
I
V
V
T
I
L
L
40
                   
                   
L
L
A
F
L
F
L
M
R
K
50
                   
  ICL1 TM2    
I
Q
D
C
S
Q
W
N
V
L
60
                   
                   
P
T
Q
L
L
F
L
L
S
V
70
                   
                   
L
G
L
F
G
L
A
F
A
F
80
                   
  ECL1 TM3    
I
I
E
L
N
Q
Q
T
A
P
90
                   
                   
V
R
Y
F
L
F
G
V
L
F
100
                   
                   
A
L
C
F
S
C
L
L
A
H
110
                   
                   
A
S
N
L
V
K
L
V
R
G
120
                   
ICL2 TM4      
C
V
S
F
S
W
T
T
I
L
130
                   
                   
C
I
A
I
G
C
S
L
L
Q
140
                   
                   
I
I
I
A
T
E
Y
V
T
L
150
                   
      ECL2      
I
M
T
R
G
M
M
F
V
N
160
                   
  TM5            
M
T
P
C
Q
L
N
V
D
F
170
                   
                   
V
V
L
L
V
Y
V
L
F
L
180
                   
                   
M
A
L
T
F
F
V
S
K
A
190
                   
  ICL3          
T
F
C
G
P
C
E
N
W
K
200
                   
TM6              
Q
H
G
R
L
I
F
I
T
V
210
                   
                   
L
F
S
I
I
I
W
V
V
W
220
                   
                   
I
S
M
L
L
R
G
N
P
Q
230
                   
    ECL3 TM7  
F
Q
R
Q
P
Q
W
D
D
P
240
                   
                   
V
V
C
I
A
L
V
T
N
A
250
                   
                   
W
V
F
L
L
L
Y
I
V
P
260
               
 
 
            ICL4
E
L
C
I
L
Y
R
S
C
R
270
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
H8                
Q
E
C
P
L
Q
G
N
A
C
280
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  C-term      
P
V
T
A
Y
Q
H
S
F
Q
290
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
V
E
N
Q
E
L
S
R
A
R
300
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
D
S
D
G
A
E
E
D
V
A
310
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
T
S
Y
G
T
P
I
Q
P
320
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
Q
T
V
D
P
T
Q
E
C
F
330
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
I
P
Q
A
K
L
S
P
Q
Q
340
 
 
 
 
 
         
D
A
G
G
V
                   
N-term        
M
Y
K
D
C
I
E
S
T
G
10
                   
                   
D
Y
F
L
L
C
D
A
E
G
20
                   
  TM1            
P
W
G
I
I
L
E
S
L
A
30
                   
                   
I
L
G
I
V
V
T
I
L
L
40
                   
                   
L
L
A
F
L
F
L
M
R
K
50
                   
  ICL1 TM2    
I
Q
D
C
S
Q
W
N
V
L
60
                   
                   
P
T
Q
L
L
F
L
L
S
V
70
                   
                   
L
G
L
F
G
L
A
F
A
F
80
                   
  ECL1 TM3    
I
I
E
L
N
Q
Q
T
A
P
90
                   
                   
V
R
Y
F
L
F
G
V
L
F
100
                   
                   
A
L
C
F
S
C
L
L
A
H
110
                   
                   
A
S
N
L
V
K
L
V
R
G
120
                   
ICL2 TM4      
C
V
S
F
S
W
T
T
I
L
130
                   
                   
C
I
A
I
G
C
S
L
L
Q
140
                   
                   
I
I
I
A
T
E
Y
V
T
L
150
                   
      ECL2      
I
M
T
R
G
M
M
F
V
N
160
                   
  TM5            
M
T
P
C
Q
L
N
V
D
F
170
                   
                   
V
V
L
L
V
Y
V
L
F
L
180
                   
                   
M
A
L
T
F
F
V
S
K
A
190
                   
  ICL3          
T
F
C
G
P
C
E
N
W
K
200
                   
TM6              
Q
H
G
R
L
I
F
I
T
V
210
                   
                   
L
F
S
I
I
I
W
V
V
W
220
                   
                   
I
S
M
L
L
R
G
N
P
Q
230
                   
    ECL3 TM7  
F
Q
R
Q
P
Q
W
D
D
P
240
                   
                   
V
V
C
I
A
L
V
T
N
A
250
                   
                   
W
V
F
L
L
L
Y
I
V
P
260
               
 
            ICL4
E
L
C
I
L
Y
R
S
 

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7

 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
ECL2
 
TM5
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
  


DIAGRAMS

ICL1 Q ICL1ECL1 I E L ECL1ICL2 C V S F ICL2ECL2 R G M M F V N M ECL2ICL3 F C G P C E N ICL3ECL3 R Q P ECL3N-term M Y K D C I E S T G D Y F L L C D A E G P N-termC-term V T A Y Q H S F Q V E N Q E L S R A R D S D G A E E D V A L T S Y G T P I Q P Q T V D P T Q E C F I P Q A K L S P Q Q D A G G V C-term W G I I L E S L A I L G I V V T I L L L L A F L F L M R K I D C S Q W N V L P T Q L L F L L S V L G L F G L A F A F I N Q Q T A P V R Y F L F G V L F A L C F S C L L A H A S N L V K L V R G S W T T I L C I A I G C S L L Q I I I A T E Y V T L I M T T P C Q L N V D F V V L L V Y V L F L M A L T F F V S K A T W K Q H G R L I F I T V L F S I I I W V V W I S M L L R G N P Q F Q Q W D D P V V C I A L V T N A W V F L L L Y I V P E L C I L Y Q E C N A C P L Q G P

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated

DELETIONS

  • from 269 to 345

  • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS


    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description

    Remarks:

    CRYSTALLIZATION

    METHOD:
    TYPE: ()
    PROTEIN CONCENTRATION:
    Temperature:
    ph : -

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration